波音747-400是747-300的改良和增程型，增加了翼尖小翼，驾驶舱设计属于玻璃座舱，需要的仪表、按键和刻度盘由971个减少至365个，需要的飞行员由三人减少至两人（取消飞行工程师）。747-400的发动机和客舱内部都有所修订，并在飞机尾翼增加了一个燃料缸，使航程增加了，能够不用在中途加油站停留。首架747-400在1989年2月交付，最后一架2005年4月交付，2007年3月波音宣布停产。