737-100是737系列的基本型，机身横切面和驾驶舱外貌与波音707和727相同，同样采用普惠JT8D发动机，但取消了飞行工程师一职。
汉莎航空为737-100的最大客户，在1965年3月15日签订合同，订购至少21架737-130，并在1967年2月24日提升至24架，但在1968年8月5日减至22架。首架交付给汉莎航空的737-100，于1968年2月开始投入商业飞行。最后一架在1969年10月交付给的马来西亚-新加坡航空。
波音737诞生在空运市场快速增长的年代，由于-200型的载客量比-100型多30人，航空公司宁选购载客量较多的-200型，因此只生产了30架。由于燃料消耗效能差、高噪音等缺点，同时因为其不断上升的维修成本，所以波音737-100陆续退役，仅存的波音737原型机（现由美国太空总署所有）被安放在西雅图的飞行博物馆展览。